合众地方旅行的小智、艾莉丝、天桐一行人，来到了被称为“大地之剑”的塔为中心发展的城市：艾茵多奥克。这里是由曾经繁荣一时的大地之民所建立的国度，但现在已经落殁。

小智等人为了参加收获祭对战大会来到艾茵多奥克，他们在这里遇到了能给予人或神奇宝贝不可思议力量的幻之宝可梦——比克提尼。大地之民的后裔——德雷多企图利用比克提尼的魔力让早已绝迹的古王国重现人间，艾茵多奥克因此陷入前所未有的混乱。

究竟小智一行人能不能拯救陷入危机的城市呢？比克提尼的命运将会如何？伴随著捷克罗姆、雷希拉姆的谜团，神奇宝贝史上最大的冒险，带给你无限的感动！