ＴＶシリーズに新作画パートを加え、新解釈の三部作として劇場版へと昇華した人気ＳＦロボットアニメの完結編。連邦軍同士の内戦に２つの勢力が割って入り、それぞれの思惑を胸に熾烈な総力戦を繰り広げていくさまを、デジタル技術を駆使したスピード感溢れるタッチで描く。
　地球圏での戦乱が混迷を極めている宇宙世紀0087年。カミーユ、シャアらの反地球連邦組織エゥーゴは、連邦軍のエリート組織ティターンズと激しい攻防戦を展開していた。さらに、自軍のティターンズを掌握せんと目論む木星輸送船ジュピトリスの指揮官パプテマス・シロッコ、そしてザビ家の復興を掲げる旧ジオン軍残党アクシズの指導者ハマーン・カーンまでもがこの激戦に絡み合う。こうして彼らは、地球圏を制するための重要拠点、巨大レーザー砲に改造されたスペースコロニーのグリプス２を巡り、未曾有の最終局面へと向かっていく…。