まだ幼かったあの日。
父はアネモネを残して戦いに赴き、そして帰ってこなかった。

アネモネの小さな胸に深く残る後悔。彼女の心を支えたのは、
ぬいぐるみのガリバーとAIコンシェルジュ・ドミニキッズ。

７年が経過し、アネモネは父が散った戦場――東京にいた。

アネモネは実験部隊アシッドが実行する作戦の要として、
人類の敵「７番目のエウレカ＝エウレカセブン」と戦わなくてはならないのだ。

エウレカセブンにより追い詰められた人類は、もはやアネモネに希望を託すしかなかった。

そしてアネモネは、エウレカセブンの内部へとダイブする――。