故事舞台是在遥远的未来，部分人类离开太阳系外，发展出高度的文明，这个文明的一架废弃机体(Turn X)漂流回到地球上，地球上的人惊觉外面有极高文明的人类，自己却连逆向工程复制一架废弃机体都做不到(过程中产生了Turn A)，地球上的人分成了两派，一方认为应该继续全力发展现存文明，急起直追；另一方则认为继续发展不可能追上，只有毁灭文明，重新从其他方式发展才能够追上。两派地球人各持Turn X和Turn A交战，在交战过程中，Turn A破坏了地球文明，部分留守地球的人在地球上重新建立起文明，而科技再度发展到类似第二次科技革命的时代。
而被留在月球上冯 布朗的居民Moonrace，则是保存了以前人类地球居民文明所发展的高科技（但仍然和太阳系外有重大差距）。留在月球上的居民想要重回地球居住，于是派遣了“先遣部队”作实验性移民并和留守地球的人类接触。
二年后“先遣部队”成功后确认了自己适应当代地球后，而派遣了先锋部队Dianna Counter来到了Amercia（原来的美洲），想为月球人的移民做预备。而这个举动惹怒了Amercia上的各领地，其后双方谈判不果。于是在地球跟月球就开始了小规模的冲突。及后月球军方首领战斗神吉姆=金卡拉姆叛变，亦加入战争。
而部队Dianna Counter的成员罗兰，在经过两年适应并融入当地后，于成人仪式上遭遇迪亚娜回归军攻击村庄，无意中启动了被地球人误会为神像，旧地球守军的最强（曾经让人类文明濒临灭亡）MS Turn A Gundam，故事正式开始。